Usa-Places.com a répertorié environ 10 écoles dans El Cajon. Certains des mieux notés écoles dans El Cajon sont- Collège de Los Coches Creek, Véritable agence de recrutement d'entreprise bleue, LCC, École de menuiserie Paragon, Bostonia Language Academy SOF'S SCHOOL, École primaire Magnolia, École communautaire du comté de l'Est, École primaire WD Hall, Centre de ballet Est & Literacy First Junior Academy.