Usa-Places.com a répertorié environ 8 des églises dans Waupun. Certains des mieux notés des églises dans Waupun sont- L'église de la rivière, Église évangélique luthérienne Grace - Synode WELS, Église réformée d'Alto, Union-Congrégationaliste unie, Église communautaire d'Edgewood, Église chrétienne de Béthel, Église réformée de la Trinité & Grace United Reformed Church.